SQL Server desde su versión 2008 tiene la funcionalidad TDE (Transparent Data Encryption) la cual permite encriptar toda la base de datos de forma transparente.
Esta funcionalidad hasta MSSQL 2019 solo estaba disponible en la edición Enterprise pero a partir de 2019 ya se puede usar en la Standard.
En el siguiente video te muestro paso a paso como se configura TDE y funciona como así también algunos tips que seria bueno considerar.
Para poder descargar el material que utilice en el video lo podes hacer desde el siguiente link